Создан алгоритм в области биоинформатики, который позволяет обнаруживать ранее неизвестные изоформы белков, связанных с развитием болезни Альцгеймера. Этот метод открывает новые возможности для создания медикаментов.
Российские исследователи создали биотехнологический алгоритм, который способен предсказывать структуру неизученных белков-мишеней, которые могут быть вовлечены в развитие болезни Альцгеймера. Это достижение даст новый толчок для поиска современных терапевтических решений.
Суть данного метода состоит в анализе так называемого альтернативного сплайсинга — процесса, при котором из одного гена могут формироваться различные варианты РНК, приводящие к образованию различных форм белка. При болезни Альцгеймера баланс этих изоформ может быть нарушен, что приводит к появлению патологически активных белков.
Алгоритм под названием TMTCrunch был протестирован на базе данных, содержащей свыше 420 образцов мозговой ткани — как от пациентов с болезнью, так и от здоровых людей. Это позволило исследовать, какие именно изоформы белков появляются или исчезают при нейродегенеративных процессах.
Анализ продемонстрировал, что при болезни Альцгеймера происходят значительные изменения в таких системах, как ионный транспорт, динамика цитоскелета и сплайсинг РНК — в тех процессах, которые уже давно связывают с гибелью нейронов и нарушениями функции мозга. По словам ведущего научного сотрудника проекта Ирины Тарасовой из ФИЦ химической физики имени Семенова РАН, новый подход позволяет ускорить выявление белков-мишеней, что крайне важно для создания специфических лекарств.
< Фото: hi-tech.mail.ru