Ученые Санкт-Петербургского государственного университета (СПбГУ) разработали программу для обработки результатов анализа геномов микроорганизмов в биологических материалах. Эта уникальная в мире разработка учитывает особенности микробиома России, сообщается в пресс-службе университета.
«Граждане каждой страны различаются друг от друга наличием определенных бактерий и их количеством. До недавнего времени анализ микрофлоры россиян проводился на основе данных из других государств, поскольку информации о микробиоме нашей страны было недостаточно. Мы исправили эту проблему»,— отметил младший научный сотрудник кафедры генетики и биотехнологии СПбГУ Лаврентий Данилов.
Добавляется, что анализ бактериальной флоры назначается при инфекциях, чтобы точно определить патоген и начать целенаправленное лечение. Выявить возбудителя стандартными методами, например, с помощью бакпосева или ПЦР, удается не всегда. В таких ситуациях врачи используют метагеномное секвенирование — анализ микробного сообщества в биологических материалах на основе определения выделенной из образца последовательности ДНК.
Согласно данным пресс-службы, разработка ученых — программа Antimicro, которая обрабатывает загруженные пользователем данные и затем формирует заключение. В нем содержится информация о том, сколько бактерий и каких видов присутствует в образце, а также уровень их антибиотикорезистентности.
Antimicro полностью на русском языке, также в программе имеется подробная инструкция, чтобы даже неопытный пользователь мог разобраться во всех ее функциях. Кроме основного модуля для анализа метагенома, разработчики добавили несколько дополнительных — справочник микроорганизмов и лекарственных средств, отдельный раздел для подбора терапии.
Как отметили в университете, ученые СПбГУ планируют получить на программу сертификат соответствия в Министерстве здравоохранения РФ. Это значительно расширит возможности пациентов, и исследование можно будет провести не только на платной основе, но и по ОМС. На сегодняшний день сертификата нет ни у одного аналогичного продукта.
Область применения
В пресс-службе СПбГУ уточнили, что Antimicro будет полезна во многих медицинских областях. У врачей появится возможность спасать больше жизней и снижать проявления тяжелых хронических заболеваний, связанных с изменениями в микробиоме и приводящих к инвалидизации. Также программа окажется востребованной в фармакологии, экологии, биотехнологии, сельском хозяйстве и пищевой промышленности.
Фото: hi-tech.mail.ru